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El concepto fue popularizado por el bioquímico de la Universidad de Lehigh [[Michael Behe]] en su libro de 1996 [[Darwin's Black Box]]. Los teóricos del diseño inteligente argumentan que, si bien algunos sistemas y órganos pueden explicarse mediante la evolución, los que son irreduciblemente complejos deben haber sido ensamblados por un agente de inteligencia.
Hay muchos ejemplos de [[máquinas moleculares]], como el flagelo bacteriano , que se componen de numerosos elementos. Behe señala con razón que tales máquinas son irreduciblemente complejas en el sentido de que si se quitara cualquier parte, la función en cuestión se perdería instantáneamente. Entonces, ¿cómo podría construirse gradualmente una máquina así si no funcionará en ningún grado seleccionable hasta que todas sus partes estén presentes en el orden correcto?